Hallo Dirk,
das Problem ist bekannt bei den Seglern, wo oft Hilfsmotoren im Schacht gefahren werden. Da jeder Motor Frischluft braucht für einwandfreie Verbrennung in den Zylindern, braucht der Schacht auch noch eine Öffnung nach oben.
In der Praxis werden hier fast ausschließlich 4-Takt Outboarder benutzt, da diese meistens den so wichtigen Auspuff im Prop haben.
Die alten 2-Takter sind im Schacht nicht mehr in, weil sie stinken im Cockpit und vergiften die Crew. Mit aufbohren im Schaft veränderst Du die innere Strömungstechnik. Lasse das bitte und tausche den Motor unbedingt gg. einen modernen 4-Takter mit Auspuff im Prop. In dem unteren Schachtbereich am Rumpf sollten Klappen sein die den Motorschaft abdichten nach oben. Am besten Du läßt Dich von einem Bootsbauer dazu beraten.